滨州市妇幼保健院（滨州市儿童医院）始建于1964年，1997年3月迁至此址，是市属为妇女儿童提供公共卫生和基本医疗服务的专业机构。作为全市妇幼卫生工作技术指导中心，担负着全市母婴保健技术指导、人员培训、信息统计管理、新生儿疾病筛查、婚前医学检查、出生医学证明管理等工作。先后荣获山东省卫生工作先进集体、山东省妇幼保健工作先进集体、山东省创建爱婴市先进集体、山东省三八红旗集体、山东省“巾帼建功”先进集体和全市职业道德建设先进单位等荣誉称号，1999年12月卫生部命名为爱婴医院。 2011年被市委、市政府命名为市级文明单位。2013年3月经市编办批准成立滨州市儿童医院，与市妇幼保健院一个机构两个牌子。
滨州市妇幼保健院现有卫生专业技术人员占全院人员的85%,业务科室设有妇女保健科、儿童保健科、妇产科、内儿科、新生儿疾病筛查中心及影像、检验相关医技科室，床位69张。拥有奥地利产全自动酶标分析仪、日本产全自动生化分析仪、德国产全数字彩超机、日本产奥林巴斯生物显微镜、德国产胎儿监护仪、意大利产高档四维彩超等大型设备。
本院业务工作主要包括两部分:一是社会保健和公共卫生服务。承担着全市妇幼卫生业务管理和技术指导、妇幼卫生项目管理、母婴保健技术培训、信息统计、新生儿疾病筛查及市直女职工和托幼机构卫生保健管理等工作；二是临床医疗服务。开展妇女儿童保健和妇产科、儿科、内科常见病的诊治，儿童听统感统训练，引流产、妇科手术、住院分娩等业务服务。先后开展了乳腺疾病治疗、儿童自闭症多动症康复、儿童视力筛查、中西医结合治疗不孕不育等特色专业项目。乳腺门诊是国家中医药管理局“三才配穴”诊治乳腺疾病应用基地。不孕不育门诊被确定为山东中医药大学第二附属医院中西医结合治疗不孕不育协作基地，山东中医药大学第二附属医院生殖医学中心主任、全国知名生殖医学专家定期来院义诊。儿童康复门诊是省残疾儿童康复定点机构。
妇产科作为临床科室，能开展剖宫产、宫外孕手术、子宫肿瘤切除、卵巢肿瘤切除等各种手术。实行全程优质护理服务，坚持出院患者100%回访，24小时住院免费接送， 2012年率先在市级医院推出“先住院、后付费”服务模式，多项住院项目住院费用实行单病种包干服务，尽量减轻患者就医负担，为服务对象提供便捷、优质、安全的医疗保健服务。
儿科作为全市唯一市属公立儿童医院，设备先进，病房温馨，诊疗规范，技术精湛的医疗护理专家团队，开展儿童医疗、保健一条龙服务。 市新生儿疾病筛查中心于1999年7月正式成立，开展了新生儿四病筛查、运用串联质谱26种疾病筛查和听力筛查，负责全市新生儿疾病筛查工作的人员培训、技术指导、业务管理、质量监督、实验检测和可疑病例的确诊、治疗、随访任务。根据公共卫生妇幼项目实施工作的需要，在全市所有项目实施单位（包括乡镇卫生院或社区卫生服务中心、妇幼保健机构、县级以上助产机构、民营妇产医院等）全部完成网络连接，设市网络信息中心1处、县区分中心9处、服务站点126处。
儿童康复门诊是是专门从事儿童自闭症（孤独症）及儿童智力发育代下诊疗、康复训练医教相结合的公立机构。以自闭症（孤独症）、儿童智力低下康复训练为主，集语言开发、感觉统合训练、儿童潜能开发于一体的专业康复训练机构。为孩子提供专业的训练和专业的感统训练。 中心采用个别化教育（IEP）,实行一对一训练的方式，为每一位儿童做综合评估，制定个体化训练方案，采用目前国际最先进的应用行为分析法（ABA）、TEACCH结构化教育法、感觉统合训练法、奥尔夫音乐教育法，为自闭症儿童、智力发育障碍儿童提供语言训练、交流训练、认知训练、生活自理训练等。是省残疾儿童康复定点机构。 为更好地满足全市妇女儿童的医疗保健需求，经市卫生局报请市政府同意，近期拟在滨州新区建设一所高起点、高标准的现代化三级妇幼保健院（儿童医院）。届时，本院的服务功能将更趋完善，综合业务服务能力将大幅增强。
