研究所的组建基础是中国科学院长春综合研究所土木建筑研究室。研究所于1952年底在黑龙江省哈尔滨市开始筹建，1954年11月正式成立，定名为中国科学院土木建筑研究所；1963年5月研究所更名为中国科学院工程力学研究所，1970年7月起研究所接受国家地震局和中国科学院双重领导，1984年4月研究所正式划归国家地震局并更名为国家地震局工程力学研究所，1998年4月研究所随着国家地震局更名为中国地震局而更名为中国地震局工程力学研究所。中国地震工程学奠基人刘恢先院士担任研究所首任所长，接着胡聿贤院士、谢君斐研究员、谢礼立院士、冯启民研究员、齐霄斋研究员、王自法研究员、孙柏涛研究员先后担任所长。现任所长是李山有二级研究员。
研究所是中国最早从事地震工程研究的科技机构，现为国内唯一以地震工程学为主要研究领域的国家公益性科研院所。现有研究方向包括：强震动观测及其应用、工程地震学、建筑工程抗震、生命线地震工程、岩土地震工程、防震减灾理论与对策、地震工程试验技术、地震与工程振动测量技术等。研究所是国家的“地震工程国际科技合作示范基地”和“创新人才培养示范基地”，设有城市工程系统抗震韧性关键技术黑龙江省“头雁”团队，中国大陆地区地震灾害模拟与评估、地震预警与工程紧急处置、岩土工程灾害风险分析与防治、工程抗震防灾韧性等4个中国地震局科技创新团队。
研究所设有地震预警与工程紧急处置、地震作用与地震区划、工程抗震防灾韧性、工程抗震与城市减灾、地震灾害风险评估与韧性城乡防灾、岩土工程灾害风险分析与防治等6个所级科技创新团队，以及地震工程基础研究中心、防灾减灾工程技术研究中心、恢先地震工程综合实验室、科技杂志社等科技部门。设有所务办公室、科技发展部、人才资源部、计划财务部、党群工作办公室、纪检室、离退休工作办公室、北京园区管理办公室以及后勤管理服务中心等管理服务部门。
研究所拥有一支实力雄厚的科技队伍，现有院士4人（含兼职2人）、研究员29人（含二级研究员6人）、副高级职称专家80余人；现有国家百千万人才工程入选者3人，国家有突出贡献的中青年专家6人，国务院政府特殊津贴获得者14人，国家重点研发计划项目负责人5人，中国地震局领军人才3人，黑龙江省“龙江学者”特聘教授和青年学者各1人，黑龙江省杰出青年基金获得者2人。
研究所是国家首批硕士、博士学位授权单位，现有土木工程一级学科博士学位授权点以及土木工程、仪器科学与技术和力学等3个一级学科硕士学位授权点，设有土木工程博士后科研流动站。现有专兼职博士生导师40余人、硕士生导师60余人，每年招收博士研究生30人、硕士研究生120人、博士后若干。
研究所建有地震工程与工程振动中国地震局重点实验室、灾害预警与工程防御黑龙江省重点实验室、黑龙江省防震减灾工程技术研究中心，拥有地震模拟振动台阵、伪动力试验设施、土工离心机振动台、超低频振动计量标准装置、土动力试验装置、多功能静力触探车等构成的国际先进、国内领先的地震工程综合试验系统。
近年来，研究所主持了国家973计划项目、国家科技支撑计划项目、国家重点研发计划项目、国家自然科学基金重点项目等一批国家级重要科研项目，在性态抗震设计理论及应用、大型复杂结构在线混合试验、城市地震灾害模拟、地震风险评估与区划、地震砂土液化等诸多方面取得国内领先科研成果，2015年和2016年牵头获得国家科技进步一等奖和二等奖各1项，2019年参与获得国家科技进步一等奖1项。
研究所组织编写了我国第一部抗震设计规范草案（1959年），主持编写了《核电厂抗震设计规范》《建筑工程抗震性态设计通则》《中国地震烈度表》等20余部国家、行业和地方技术标准，参与编写了《建筑抗震设计规范》《中国地震动参数区划图》等40余部国家和行业技术标准；出版了《唐山大地震震害》《地震工程学》《基于性态的抗震设防与设计地震动》《工程波动理论导论》《中国防震减灾百科全书：地震工程学》等数十部学术专著；编辑出版《地震工程与工程振动》《自然灾害学报》《世界地震工程》等3本中文核心期刊，以及《Earthquake Engineering and Engineering Vibration》SCI和EI双检索英文期刊。
研究所是中国地震局地震灾害风险评估与防治、地震破坏调查与烈度评定、房屋建筑安全鉴定、地震预警与烈度速报以及强震动观测的技术牵头单位。牵头承担汶川、芦山、玉树、九寨沟等破坏性地震的烈度评定与工程震害科学考察，牵头组织实施国家地震科技创新工程“韧性城乡”科学计划，主力支撑国家自然灾害防治重点工程之“地震易发区房屋设施加固工程”。
研究所是中国地震工程联合会、中国地震学会地震专业委员会、中国灾害防御协会城乡韧性与防灾减灾专业委员会、黑龙江省地震工程学会的挂靠单位，联合发起和主办全国地震工程学术大会，承办了第14届世界地震工程大会。与美国、欧盟、日本、韩国等三十多个国家以及中国香港、澳门、台湾等地区的科技机构有长期和广泛的科技合作，享有很高的国际学术声誉。研究所专家不间断地担任国际地震工程协会中国国家代表，并多次当选为理事、执行理事或副理事长。
研究所将面向世界科技前沿、面向国家重大需求、面向国民经济主战场、面向人民生命健康，围绕防震减灾开展高水平科学研究、行业应用和社会服务，努力建成国内一流、国际有重要影响的科研机构。
