新疆维吾尔自治区教育厅作为自治区人民政府组成部门，主管全区教育工作。新中国成立后的1950年，新疆省成立教育厅；1970年9月改教育厅为教育局；1982年改教育局为教育厅；1986年改教育厅为教育委员会，2000年8月改教育委员会为教育厅。
自治区教育厅主要职责是：
（一）全面贯彻执行党和国家有关教育工作的方针政策、法律法规，拟定自治区教育改革与发展的政策和规划，起草有关法规规章和管理办法并监督实施。
（二）负责各级各类教育的统筹规划和综合协调，制定教育事业发展规划和计划，确定教育事业发展重点、规模、速度和步骤，指导各级各类学校的教育教学改革；负责教育基本信息的统计、分析和发布。
（三）负责国家通用语言文字宣传规划、规范推广、普及应用等工作；负责国家通用语言文字的社会学习、普及学习和再培养培训。
（四）会同相关部门编制自治区级教育经费和项目预算，规划实施并监督管理；拟订教育经费筹措、管理和学生资助的政策；协调指导各级各类学校家庭经济困难学生资助管理工作。
（五）指导各级各类学校的思想政治建设和德育工作、体育卫生艺术教育、劳动实践教育和科学教育，协助有关部门做好学校国防教育和军训工作。
（六）指导教育系统单位、各级各类学校的安全稳定和政治保卫；做好应急协调和维稳措施的督促落实工作。
（七）负责义务教育的宏观指导和协调，推进义务教育均衡发展，促进教育公平；指导普通高中教育、学前教育、特殊教育和民办教育工作。
（八）统筹指导各类高等教育和继续教育的发展改革、学科设置和专业评估；协调指导和支持现代大学办学政策落实。
（九）统筹指导职业教育发展改革和职业指导工作；参与拟定普通高等学校、中等职业学校毕业生就业政策，指导开展就业创业工作。
（十）指导教育系统人才队伍建设，主管教师培养规划和组织实施工作；负责教师资格认定和继续教育等工作。
（十一）负责各级各类学校教材和中小学教辅用书的编译、审定、备案和出版工作。
（十二）负责管理学历教育及其考试工作，统筹各级各类招生计划并组织实施；实施国家学位制度，负责自治区学位规划和授予工作。
（十三）指导教育系统自然科学和哲学社会科学研究，以及科技成果转化、教育信息化和产学研结合等工作。
（十四）统筹国际国内及港澳台教育交流与合作；负责汉语国际推广和孔子学院建设工作；负责教育系统涉外项目和事务的组织实施和协调联系。
（十五）负责民族语言文字规范化、标准化、信息化工作；负责民族语言文字改革工作；负责有关民族语言文字监测、研究、科研和文化保护工作；承担民族语言文字翻译专业人才规划和培养培训工作；组织民族语言文字翻译职称评定工作。
（十六）承担自治区人民政府教育督导委员会的具体工作，制定教育督导计划和评估方案，并进行指导、监督、检查和评估。
（十七）完成自治区党委、自治区人民政府交办的其他任务。
