山南市自然资源局是主管全市自然资源确权登记、国土空间规划、国土空间用途管制、自然资源开发利用的政府职能部门，业务方面受西藏自治区自然资源厅监督指导。山南市自然资源局机构设置及职责：
（一）办公室。负责局机关工作的综合协调和工作督办，承办机关日常运转工作。承担信息、机关安全、保密、信访、督查、法制宣传、新闻宣传、政务公开等工作，组织开展矛盾纠纷排查调处。参与组织起草自然资源方面的地方性法规草案和政府规章草案，负责部门规范性文件审核、清理。开展重大问题调查研究，负责重要文件文稿起草，协调自然资源领域综合改革有关工作。组织编制全市自然资源发展战略、中长期规划和年度计划。开展自然资源领域对外交流合作。负责干部人事管理、机构编制、劳动工资、干部教育培训、人才队伍建设和离退休干部职工管理服务等工作。负责机关和所属事业单位党群工作。负责机关和所属事业单位财务及国有资产监管，负责部门预决算、政府采购、国库集中支付、内部审计工作。参与管理自然资源资产有偿使用和专项收入征管监督等相关工作。
（二）自然资源调查监测科。根据国家、自治区自然资源调查监测评价指标体系和统计标准，建立、落实地方自然资源定期调查监测评价制度。定期组织实施全市自然资源基础调查、变更调查、动态监测和分析评价。组织开展水、森林、草原、湿地资源和地理国情等专项调查监测评价成果的汇交、管理、系统维护、共享和利用监督。贯彻实施全民所有自然资源资产管理政策，建立全民所有自然资源资产统计制度，承担自然资源资产价值评估和资产核算工作。编制全民所有自然资源资产负债表，拟定相关考核标准。拟定实施全市测绘地理信息和基础测绘规划、计划及建设项目，管理维护测绘基准、系统和标志，监管测绘活动、质量、成果，监督实施测绘地理信息安全保密政策，审核重要地理信息数据，负责地图管理，提供测绘地理信息应急保障。
（三）自然资源确权登记科。贯彻执行各类自然资源和不动产统一确权登记、权籍调查、不动产测绘、争议调处、成果应用的制度、标准、规范。指导、监督全市自然资源和不动产确权登记工作。建立健全自然资源和不动产登记信息管理基础平台，指导协调自然资源和不动产登记资料收集、整理、共享、汇交管理。指导城乡建设用地增减挂钩工作。
（四）国土空间规划科。贯彻执行国家、自治区国土空间规划相关政策，承担建立地方空间规划体系工作并监督实施。组织编制全市主体功能区等国土空间规划和相关专项规划并监督实施。承担报自治区、市人民政府审批的国土空间规划的审核、报批工作，组织编制涉及国土空间开发利用的重大专项规划。开展国土空间开发适宜性评价，建立国土空间规划监测、评估和预警体系。执行国土空间规划有关技术标准、规程规范。研究拟订开展城乡规划管理的政策措施并监督实施。
（五）国土空间用途管制科。贯彻执行国土空间用途管制制度规范和技术标准。制定土地利用年度计划并监督实施。承担耕地、林地、草地、湿地等国土空间用途转用工作，负责建设项目用地预（初）审工作。承担报市级以上政府审批的各类土地用途转用的审核、报批工作。拟定并实施耕地保护政策措施，组织实施耕地保护责任目标考核和永久基本农田特殊保护，负责永久基本农田划定、占用、补划和耕地占补平衡的监督管理。负责、指导土地征收征用管理工作。指导节约集约利用土地，负责耕地保护政策与林地、草地、湿地等土地资源保护政策的衔接，监督指导县（区）严格控制新增建设用地。
（六）国土空间生态修复科。贯彻执行国土空间生态修复政策措施，承担地质灾害的预防和治理工作，组织编制国土空间生态修复规划和地质灾害防治规划。组织实施有关生态修复重大工程和地质灾害治理工程，开展国土空间综合整治、土地整理复垦、矿山地质环境恢复治理等工作。协调组织地质灾害的排查、巡查、调查。指导开展地质灾害群测群防、专业检测和联合预报预警等工作。严格执行国土空间自然资源领域生态保护补偿制度，推进合理利用治理基金、社会资金进行国土空间生态修复，承担生态保护补偿相关工作。监督管理地下水过量开采引发的地面沉降等地质问题。指导监督县（区）国土空间生态修复和地质灾害防治工作。
（七）矿产管理与地质勘查科。拟定全市矿业权管理政策并组织实施。管理市级地质勘查项目，协调配合实施重大地质矿产勘查专项。承担全市各类矿业权的统计分析工作，参与监督管理保护性开采的特定矿种、优势矿产的开采总量控制及相关管理工作。监督指导矿产资源合理开发利用和保护。编制市级矿产资源总体规划、地质勘查规划和砂、石、黏土矿业权设置方案。制定砂、石、黏土采矿权基准价并组织实施。承担砂、石、黏土矿产资源储量评审、备案、登记、统计和信息发布，开展压覆砂、石、黏土矿产资源审批管理。贯彻执行国家自然资源有偿使用制度，根据法定权限管理砂、石、黏土矿业权的出让及审批登记。监督管理地质勘查资料汇交、保管和利用。监督管理古生物化石。指导调处矿业权重大权属纠纷。
（八）山南市自然资源行政执法队。宣传贯彻执行自然资源、规划方面的法律法规规章以及综合行政执法方面的政策方针，并依法依规监督执行情况。负责指导、规范全市自然资源执法监督行为，依法履行自然资源执法监督职责，负责全市土地矿产卫片执法检查，依法督促整改；负责指导、监督全市自然资源开发利用、国土空间规划及测绘等自然资源领域执法工作，负责法律法规指定由市一级承担的自然资源领域行政执法工作，受理相关问题线索、投诉，组织查处全市跨区域和具有重大影响的复杂案件；配合自然资源督察工作，指导、监督县（区）督察整改有关工作；监督指导辖区内自然资源行政执法体系建设和执法工作，指导、组织协调和考核评价所辖县相关执法工作；配合开展自然资源领域信访处置和重大矛盾纠纷排查化解，依法调处重大权属纠纷。
